更新时间：2023-08-30 22:21
1802年3月，法国和英国签订《亚眠和约》，停止了敌对行动。然而，双方之间仍存在许多问题，条约的执行变得越来越困难，拿破仑对英国军队没有撤离马耳他岛感到愤怒。当拿破仑派遣远征军重新控制海地时，紧张局势进一步恶化。双方在这些问题上的长期不妥协导致英国于1803年5月18日撕毁《亚眠和约》，对法国宣战。
原本在第二次反法同盟战争中遭受重大损失的奥地利帝国起初持观望态度，1805年3月，已经加冕为法兰西皇帝的拿破仑·波拿巴进一步加冕自己为意大利国王。这一举动激怒了奥地利皇帝弗朗茨二世，1805年7月，奥地利也加入了反法同盟，第三次反法同盟形成。
奥地利帝国在俄军支援下入侵法国的盟国巴伐利亚。拿破仑在8月率军东进应战，10月20日，法军炮轰乌尔姆，取得乌尔姆战役的胜利，迫使马克率领的奥军投降。同年12月2日，法、俄、神圣罗马帝国三国军队在奥斯特利茨（Austerlitz、今捷克境内）进行决战。73000人的法军在拿破仑的指挥下，取得了对86000人俄奥联军的决定性胜利，俄奥两国皇帝狼狈而逃。之后拿破仑攻入哈布斯堡领地摩拉维亚，更将奥军赶出意大利，并在普鲁士境内击败俄军。
1805年12月4日，弗朗茨二世向拿破仑求和，双方达成停火协议。12月27日，奥地利和法国签订《普雷斯堡和约》。奥地利退出反法同盟。1806年2月，法军攻入那不勒斯王国，国王费迪南德四世逃往西西里，7月，法军攻破那不勒斯最后的据点盖塔要塞，剩下的那不勒斯军队投降，反法联军撤离意大利，第三次反法同盟也随之瓦解。
《普雷斯堡和约》规定奥地利将威纳托、伊斯特拉半岛、达尔马提亚、科托尔等地割让给拿破仑治下的意大利王国，将蒂罗尔和福拉尔贝格割让给法国的盟国巴伐利亚，奥地利还须赔偿4000万法郎的赔偿金给法国。拿破仑又乘胜在南德、中德、西德各诸侯国组成“莱茵联邦”，把它置于自己的保护之下。
1806年7月，德意志16个小邦参与的莱茵联邦成立。拿破仑为了吸引更多国家加入邦联，对奥皇弗朗茨二世发出最后通牒，要求他解散神圣罗马帝国。弗朗茨二世于1806年8月6日被迫取消自己“神圣罗马帝国皇帝”的封号，仅保留奥地利帝号。至此神圣罗马帝国的历史也告终结。