约翰娜·加布里埃莱出生于1750年2月4日，是奥地利女大公玛丽亚·特蕾西娅和神圣罗马帝国皇帝弗朗茨一世的第十一个孩子和第八个女儿。

约翰娜·加布里埃莱是接二连三出生的孩子中的一员。她和她的兄弟姐妹玛丽亚·约瑟法、玛丽亚·卡罗利娜、玛丽亚·安东尼娅（玛丽·安托瓦内特）和马克西米利安·弗朗茨一起在育婴室里。在那里，他们得到了家庭教师和她们的侍从的照顾。五岁的时候，约翰娜在皇宫里有了自己的一套房间，还多了一些家教。她和兄弟姐妹的关系很好，虽然有时会和哥哥们吵架。玛丽亚·特蕾西娅鼓励她的孩子们彼此和睦相处。约翰娜·加布里埃莱被认为是特别可爱和善良的人，因此在朝廷以及庞大的皇室中非常受欢迎。约翰娜享有广泛的教育，包括阅读、写作、学习拉丁文、外语、历史、地理、土地测量、军事建筑、数学、音乐、舞蹈和体操，以及从三岁开始的宗教。