利奥三世死后，继承人仍遵守此令。直到780年，女皇伊琳娜继位后，愿意恢复对圣像的敬礼，愿意东西方教会统一，因而他得到当时宗主教圣特拉乌斯的支援，并得到教宗哈德良一世的同意，于787年，召开了第七次，尼西亚第二次大公会议。

会议结果重新阐述敬礼圣像的真正意义，教会并非敬礼圣像本身，而是敬礼圣像所代表的神或天使，或圣母、圣人。

佛希要分裂

847年即位的君士坦丁宗主教伊纳爵，虽然道德以及学识方面非凡，但是却因着自己的正直引起了拜占庭皇帝的愤怒，他被废逐。又令佛希要替其职位，佛希要曾担任过政府要职，学识也不凡，但是单单一届教友却在短时间被授与全部圣秩，这样的一步登天加上伊纳爵的废逐合法与否都是令人怀疑的，所以引起了不满的声浪。

863年，此时的罗马教宗尼克老一世也采取了行动。立即声明伊纳爵的废黜非法，以及开除佛希要的教籍。佛希要也开始了反击，他攻击西方教会更动信经的内容，甚至在867年擅自于君士坦丁堡召开会议，开除教宗教籍。这是千古之奇事──宗主教开除教皇。

双方的紧张关系越演越烈，不料支持佛希要的皇帝遭人暗杀，凶手自立为王，是为巴西略一世，他将前任一切的措施推翻，包括废逐伊纳爵跟佛希要的提升。同年教宗尼克老一世逝世，继任的雅德良二世（867年－872年）在君士坦丁堡召开第八次大公会议，东西教会统一，而东方教会也承认罗马的首席地位。

虽然佛希要分裂只维持了几年，但是却种下了日后大分裂的近因。过去罗马教皇的首席地位是无可否认的。这次事件后却有人开始质疑教皇的首席地位，甚至指控教皇篡改教义。

弥格耳分裂

这次的大分裂在佛希要分裂之后的一百六十年左右实现。这次的分裂起于君士坦丁堡牧首弥格耳·赛鲁来的野心。他决心要做东方的教宗，处心积虑的要做一个无法挽回的分裂。

公元1053年，他把东方的拉丁礼教堂全数关闭，同时致函罗马，极尽诋毁之事－－他质问罗马教宗篡改圣经内容以及教义。又说西方教会弥撒用无酵的饼是源自犹太人，是异端。安息日守大斋，准许教友吃未出血的肉。四旬日不唱哈利路亚等等。虽然这只是无关大雅的几点外表礼规而已，但是拜占庭的教友却异常的重视。

当事的教皇利奥九世（1049年－1054年）为了不让分裂再起，派了枢机主教为首的协调团至君士坦丁堡，可惜枢机主教的性情暴躁，缺乏外交手腕使的整场事件陷入了另一个低潮。

而弥格耳正好用着这次的事件再次的抨击拉丁教会，他鼓励教友反对拉丁教会。面对弥格耳这种态度，亨拜与他的同伴于1054年7月14日进入圣索非亚大教堂，对弥格耳这种顽固的态度表示抗议，将开除教籍的判书放到祭台上，待出了教堂，亨拜大声跺脚并说到──愿我上主临鉴，评判我辈！

弥格耳不肯屈服，当众把教皇送来的诏书烧毁。为了得到其他主教的同情，便夸大了枢机主教与宣达团的误会以激怒他们。更以基督正统的教会唯一的代表自居。于是东方的一切便随他而去了。这时的希腊教是正在向相异教的俄罗斯传教，她也无意中被卷入了裂教的集团中。

罗马教皇和君士坦丁堡牧首互相开除对方的教籍，标志着基督教正式分裂为罗马公教（天主教）和希腊正教（东正教）。

宗教改革

这是基督教第二次大分裂，其后新教从罗马教会分裂出了圣公宗、归正宗以及信义宗这三大支派。

人文主义的冲击

1453年奥斯曼土耳其灭亡拜占庭帝国，逃亡到西欧的学者们带来了大量的古典。文艺复兴也随这些东罗马学者的逃亡而来。又随着文艺复兴的发展，人文主义成为当时欧洲的新思想，人们开始怀疑中世纪以神为本位的人生价值，而开始认真思考以人为本位的新观点。就在这样的新思想下，基督教的人生观也慢慢的受到民众的怀疑。

工商业复兴的影响

中古世纪的欧洲大致分为教士、贵族还有骑士的上等阶级，跟农奴以及平民组成的下等阶级。随着工商业的复兴创造出了一个新的阶级──中产阶级，大多由平民商人所组成的中产阶级发展出了完善的商业组织如行会、银行等等，而之后的欧洲世界也从原本的教权转移到由君主以及中产阶级主导。

但是民生问题也随之而来，像贫富差距以及阶级对立等等。人民除了要向政府纳税，教会的各项圣礼，仪式等等也都要付费。加上教廷反对借贷生息也不利工商的发展，这样的生活使的人民对教会的怨怒越积越深。

教会的腐败

中古世纪的人民主要的心灵依靠都是宗教，对于外在的教会礼规非常重视。随着工商的发展，教会也坐拥庞大的教产，这样的富裕使神职人员的道德松懈，教会中的丑闻不断的发生。许多的高阶神职人员的职位都是以金钱而不是道德换来的，有些神父甚至连十戒与主祷文都不清楚。

有时教会为了纾解财政方面的负担，公然贩卖赎罪卷并声称有买罪有赎，没买地狱去。一些高阶神职人员甚至卷入性丑闻中，其中教宗亚历山大六世的私生活和其于1501年10月30日主持的栗子宴可以算是性丑闻中的代表事件。

人民对教会的要求日渐升高，但是教会却一项也无法完成，迫使人民转向其他神秘宗教以安抚自己的心灵。

君权与教权的消长

在中古世纪的时候，教皇对人民心中的权利远高过国王。教会也为了自己的利益而不断的干涉政治，也引发了很多皇帝与教皇的冲突事件，如神圣罗马帝国的腓特烈三世罢黜教宗，甚至出兵罗马。还有英王亨利八世直接脱离罗马教廷都是个很好了例子。

到了文艺复兴时代，民族主义的萌芽让人民不在以教宗为尊，而是以国王为大。教宗的势力也慢慢的消弱了。

马丁路德以及九十五条纲论

马丁·路德是宗教改革的先驱，他于1483年生于普鲁士，从大学开始无意读到圣经发觉与当时教会有相当的出入。又因一次的意外面临死的意境而开始思考人生的道理，其后励志成为修道人。但是就算路德成为了神父，心中依然的不平安，直到1513年在教授圣经时突然领悟因信称义的道理，而不是当时所认为的行好事上天堂的理论。

1517年他在威登保教堂揭示95条纲论，反对出售赎罪卷。这样的学术讨论却遭到教廷的指控。1520年路德被教皇定为异端，焚烧著作并且下诏开除路德教籍。路德也不屈服，也焚烧了教皇的诏书。尔后主张教廷不具圣经解释权，鼓励人民自己阅读圣经，并将圣经翻译成德文。且人与神之间不该在介入一个神父为沟通，人应自己与神建立个人关系。又认为政教应该分离。

加尔文改教

加尔文生于法国，12岁时父亲为他谋得神父的职位。1533年加尔文也在圣经中忽然领悟归正，当时更正教派在巴黎影响极大，但反对者众多，于是加尔文逃亡时也辞去了神父的职位与罗马教廷断绝关系。在1536年写了基督教要义，主张不是借由教会变质的传统去接触神，而是以圣经惟依归。人不能靠自己行善得义只有上帝可以成就一切。

其中主张是不反对借贷生息，以及上帝预选论，前者的主张得到广大中产阶级的认可与支持，而后者内容为──人在未出世得救与否就已经注定，人生则是来证明自己就是那被得救的选民。

亨利八世的脱离

亨利八世原本也是站在罗马教廷这一边，更曾经获得教皇赐与称号──信仰拥护者，也看不出他会有多大的改革。为了国家的利益，亨利娶了西班牙王室的凯特琳公主，然而正室久无产子以继承王业，加上亨利爱上一宫中贵妇波琳，亨利因而兴起了休妻的念头。

为此，他请求教皇批准，却被否决了，因为当时凯特琳的侄子神圣罗马皇帝查理五世正在攻打梵蒂冈，并且大获全胜。亨利八世因而大怒，决定视此为英国的内政来处理，却得不到国内教士的支持。

1531年，亨利强迫教士不可向教皇宣示效忠，且逼迫他们承认他为英国教会的元首，隔年又逼迫国会立法通过一项法案：没经过国王同意，不可向教廷进贡。至此，亨利八世完全的脱离了罗马的掌控。